澳门新葡亰游戏平台张绍铃团队研究成果入选2020年中国农业科学重大进展

2020-11-21 来源:梨工程技术研究中心 作者:谢智华 图片:

11月20日,由农业农村部科技教育司指导、中国农业科学院、中国农学会、农业农村部科技发展中心联合主办的2020年中国农业农村科技发展高峰论坛在南京举行。论坛上发布了《2020中国农业科学重大进展》,澳门新葡亰游戏平台张绍铃教授团队研究成果“高杂合物种单倍型基因组组装的新方法”成功入选。

植物基因组组装大多采用二倍体或者多倍体材料进行混合测序并组装,对于一些杂合度低和重复序列比例少的物种而言,单倍型基因组组装的难度并不是很凸显,但是对于一些自交亲和及高杂合的物种,单倍型染色体之间的差异会导致最终基因组存在大量嵌合组装,而利用这种嵌合基因组将不利于这些物种的后续重测序、进化、基因功能等方面的研究。

张绍铃教授团队在成功组装了世界首个梨基因组精细图谱及变异图谱的基础上,利用12个花粉单细胞对所构建的3.8万条人工染色体(BAC,bacterial artificial chromosome)进行单倍型分型,创建了基于“条形-编码”(Bar-coding)的单倍型基因组组装方法,成功组装了梨两套单倍型基因组。通过这种方法鉴定出了原参考基因组中8.12%的由于杂合引起的嵌合组装基因,并对所测的‘砀山酥梨’基因组两个单倍型之间的差异进行了系统分析。同时,这种方法不仅可以利用花粉单细胞测序对BAC进行分型,也可以结合多种长读长测序技术(如Pacbio)用于解决复杂植物基因组的单倍型基因组组装难题,有助于推动农作物及经济作物等植物基因组的研究。

该研究成果于2019年10月在基因组研究权威期刊《Genome Research》上发表,澳门新葡亰平台游戏app手机 为第一完成单位,张绍铃教授为通讯作者,澳门新葡亰平台游戏app手机 博士生施冬青为论文第一作者,吴俊教授、殷豪副教授以及福建农林大学唐海宝教授为共同第一作者,吴巨友教授、陶书田教授、齐开杰老师、谢智华老师参与了该研究工作,并得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目的资助。

中国农业科学重大进展每年评选一次,遴选时以我国各类科研机构正式发表的农业领域高水平科学研究论文为基础,根据“前沿引领、开创卓越、重大突破”的原则,经过初选、专家评审及推荐、综合遴选、解读发布等过程,最终选出10项能够充分代表当年我国农业科技前沿研究水平的基础科学研究成果。

校对:赵烨烨

编辑:崔滢

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